Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MsmbO08540 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MsmbO08540 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms