Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms