Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm37537-201ENSMUST00000192154 1738 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11243-201ENSMUST00000122335 394 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tctex1d1-206ENSMUST00000169211 1000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ldb2-205ENSMUST00000199261 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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