Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms