Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm8356J3QPD3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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