Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
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