Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21976J3QNN2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms