Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms