Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SmgcF6VRN1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms