Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atad2bE9Q166 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atad2bE9Q166 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms