Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3002E9PW72 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms