Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms