Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms