Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms