Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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