Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms