Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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