Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms