Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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