Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Samt1A2BED8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Samt1A2BED8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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