Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Prdm16A2A935 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Prdm16A2A935 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prdm16A2A935 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms