Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pramef6A2A8M8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pramef6A2A8M8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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