Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms