Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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