Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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