Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms