Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms