Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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