Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tlr5Q9JLF7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tlr5Q9JLF7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tlr5Q9JLF7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tlr5Q9JLF7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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