Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tgm1Q9JLF6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tgm1Q9JLF6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms