Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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