Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms