Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cacna1fQ9JIS7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cacna1fQ9JIS7 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cacna1fQ9JIS7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cacna1fQ9JIS7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cacna1fQ9JIS7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cacna1fQ9JIS7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacna1fQ9JIS7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms