Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ush1cQ9ES64 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ush1cQ9ES64 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ush1cQ9ES64 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ush1cQ9ES64 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ush1cQ9ES64 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ush1cQ9ES64 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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