Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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