Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms