Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms