Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmgn3Q9DCB1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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