Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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