Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Csnk1dQ9DC28 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Csnk1dQ9DC28 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csnk1dQ9DC28 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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