Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms