Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ifi35Q9D8C4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifi35Q9D8C4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifi35Q9D8C4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifi35Q9D8C4 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms