Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Tmem54Q9D7S1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tmem54Q9D7S1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tmem54Q9D7S1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem54Q9D7S1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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