Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gabra4Q9D6F4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gabra4Q9D6F4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gabra4Q9D6F4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gabra4Q9D6F4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra4Q9D6F4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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