Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc81Q9D5W4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc81Q9D5W4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc81Q9D5W4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms