Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2al3Q9D4U4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms