Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx20Q9D2Y5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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