Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trappc6bQ9D289 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trappc6bQ9D289 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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