Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cysrt1Q9D1E4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms