Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms